（1）生态过程与适应
干旱区生物多样性；干旱区景观格局与过程；绿洲生态系统与区域气候变化相互作用机制；绿洲生态系统结构、功能及稳定性。
（2）生态修复与安全
退化生态系统恢复与重建；绿洲生态系统安全；绿洲生态系统可持续发展模式；基础数据库建设及数据挖掘。
（3）系统模拟与预测
干旱区土壤盐渍化评价；LUCC时空演化模拟与趋势预测；绿洲生态系统调控与管理；绿洲生态系统调控决策支持系统。
（4）生态经济与资源利用
城镇土地定级估价、宗地地价评估、土地利用总体规划、农用土地定级估价等；水资源开发利用；数字城市。
